藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域具有豐富的公開(kāi)資源，利用人工智能技術(shù)從大數(shù)據(jù)中挖掘重要信息并構(gòu)建結(jié)構(gòu)化的知識(shí)體系，是人工智能技術(shù)在藥物信息領(lǐng)域中重要的應(yīng)用場(chǎng)景之一。英飛智藥致力于將先進(jìn)的人工智能和計(jì)算模擬技術(shù)應(yīng)用于創(chuàng)新藥研發(fā)，以數(shù)據(jù)、專家和技術(shù)為核心驅(qū)動(dòng)，打造實(shí)用的創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺(tái)——PharmaMind?。該系統(tǒng)針對(duì)實(shí)際新藥研發(fā)中的多種應(yīng)用場(chǎng)景，開(kāi)發(fā)和整合多個(gè)底層AI藥物研發(fā)模塊，能夠依據(jù)實(shí)際業(yè)務(wù)需求進(jìn)行多種工作流程適配。
本次上線的PharmaMind?客戶端V3.0版本主要集成了基于人工智能技術(shù)開(kāi)發(fā)的化學(xué)結(jié)構(gòu)圖像識(shí)別提取系統(tǒng)（MolMiner），用于高效地從相關(guān)資料中獲取高質(zhì)量的化學(xué)結(jié)構(gòu)信息。非常期待大家的關(guān)注與建議！下面介紹目前版本的一些功能。
便捷注冊(cè)
PharmaMind?目前完全免費(fèi)使用，大家可以登錄英飛官網(wǎng)下載和安裝客戶端（http://www.iipharma.com.cn），客戶端支持Windows和Mac操作系統(tǒng)。在注冊(cè)成功后，可以通過(guò)賬戶名/密碼和手機(jī)號(hào)/短信驗(yàn)證碼兩種方式登錄，也歡迎企業(yè)用戶聯(lián)系我們（service@iipharma.cn）獲取企業(yè)賬戶。
快速攫取
創(chuàng)建一個(gè)新項(xiàng)目后，隨即可點(diǎn)擊或拖動(dòng)pdf文件輕松上傳，工具將自動(dòng)進(jìn)行檢測(cè)與識(shí)別，如下圖所示，上傳一個(gè)含有429個(gè)分子的PDF文檔，完成整個(gè)識(shí)別過(guò)程僅約30 s。支持識(shí)別過(guò)程中對(duì)已完成識(shí)別的分子進(jìn)行實(shí)時(shí)查看。當(dāng)pdf文檔頁(yè)數(shù)較多時(shí)，無(wú)需等待很久就可以反饋已完成的結(jié)果，讓整個(gè)收集工作高效流暢。
圖1 上傳pdf演示
交互修改
我們上傳的資料中有時(shí)一份文獻(xiàn)中可能會(huì)出現(xiàn)重復(fù)的分子（如相同的反應(yīng)物、中間體等），或者在藥學(xué)相關(guān)專利中我們僅需要獲取有生物活性的分子結(jié)構(gòu)等等，需要使用一些必要的交互功能：
1）友好交互的分子編輯界面—MolMiner在分子編輯頁(yè)面右側(cè)集成了便捷的分子編輯器，可供使用者對(duì)識(shí)別結(jié)果進(jìn)行修改或調(diào)整等操作，完成修改后可單分子以多形式導(dǎo)出，亦或是保存直至全部分子瀏覽修改完畢，一鍵全部導(dǎo)出；在分子編輯頁(yè)面左側(cè)，MolMiner集成了pdf瀏覽器的部分功能，我們可以直接單擊想要編輯的分子，右側(cè)編輯欄也會(huì)直接跳轉(zhuǎn)到選定的分子供使用者進(jìn)行編輯操作；
圖2 分子編輯器操作展示
2）有些資料中的分子坐標(biāo)附近可能會(huì)有一些噪聲（如邊框、底色、文本、符號(hào)等）影響算法的精度，此時(shí)我們可直接在分子編輯頁(yè)面左側(cè)對(duì)原圖進(jìn)行刪除操作，也可以進(jìn)行框選重新檢測(cè)操作；
圖3 分子矯正操作展示
3）有時(shí)候需要對(duì)一張圖片上的多個(gè)分子進(jìn)行快速識(shí)別和分析，不希望他們被單獨(dú)分開(kāi)（增加操作的復(fù)雜性），我們支持一鍵多圖識(shí)別的操作提高關(guān)聯(lián)分子之間的空間耦合性。
圖4 一鍵識(shí)別多分子操作展示
截圖識(shí)別
除了上傳pdf文檔中的分子外，當(dāng)前版本的PharmaMind還增加了截圖識(shí)別功能。我們可以通過(guò)默認(rèn)或自設(shè)快捷鍵，框選截取感興趣的分子進(jìn)行識(shí)別，截圖識(shí)別的分子除了可以導(dǎo)出外，也可以收藏至所預(yù)設(shè)的項(xiàng)目下，方便之后的查閱與檢索。
圖5 截圖識(shí)別操作展示
以上是MolMiner當(dāng)前版本的功能。目前在我們嚴(yán)格的測(cè)試下，該工具的識(shí)別精準(zhǔn)度大大優(yōu)于目前所有的開(kāi)源OCSR的工具，同時(shí)每張圖片識(shí)別速度大約在50毫秒。當(dāng)然，MolMiner目前也存在著很多需要繼續(xù)提高的地方，歡迎廣大用戶多提寶貴需求與建議。您的需求與建議是我們不斷完善MolMiner的動(dòng)力。
關(guān)于智藥大腦
PharmaMind??是集成人工智能和計(jì)算模擬設(shè)計(jì)技術(shù)的創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺(tái)。目前針對(duì)實(shí)際新藥研發(fā)中的多種應(yīng)用場(chǎng)景，開(kāi)發(fā)和整合多個(gè)底層計(jì)算設(shè)計(jì)模塊，能夠依據(jù)實(shí)際業(yè)務(wù)需求進(jìn)行多種工作流程適配，推薦滿足用戶定制需求的高潛力分子。PharmaMind??目前已經(jīng)發(fā)布了兩個(gè)內(nèi)部用于新藥研發(fā)的版本。經(jīng)過(guò)實(shí)際用戶場(chǎng)景的內(nèi)部打磨，PharmaMind V3.0開(kāi)始對(duì)外發(fā)布實(shí)用的功能模塊。MolMiner是PharmaMind的對(duì)外發(fā)布的第一個(gè)模塊，后續(xù)會(huì)發(fā)布更多實(shí)用模塊在未來(lái)的版本中。目前正在部署基于靶標(biāo)口袋結(jié)構(gòu)的三維分子原位生成模塊MolBuilder, 基于AI數(shù)據(jù)模型結(jié)合物理探索口袋中的所有分子解空間，為突破分子骨架限制創(chuàng)造了無(wú)限的可能，可專用于First-in-Class新藥設(shè)計(jì)。
關(guān)于英飛智藥
北京英飛智藥科技有限公司（以下簡(jiǎn)稱“英飛智藥”）， 于 2019 年 6 月正式運(yùn)營(yíng)，是一家以創(chuàng)新藥物為目標(biāo)，以人工智能為驅(qū)動(dòng)的初創(chuàng)公司。英飛智藥技術(shù)源于北京大學(xué)團(tuán)隊(duì)近 30 年研發(fā)技術(shù)積累的轉(zhuǎn)化，團(tuán)隊(duì)曾于 2015 年發(fā)表國(guó)內(nèi)第一篇 AI 藥物設(shè)計(jì)論文，在 AI 制藥領(lǐng)域一直處于技術(shù)引領(lǐng)者的地位，尤其擅長(zhǎng)于First-in-Class藥物的源頭創(chuàng)新。英飛智藥在新藥研發(fā)中充分利用并持續(xù)發(fā)展全球領(lǐng)先的 AI 藥物發(fā)現(xiàn)技術(shù)，打造自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的 AI+新藥研發(fā)平臺(tái)——智藥大腦TM。智藥大腦是集頂級(jí)專家人才、一流AI+新藥研發(fā)平臺(tái)、前沿藥物設(shè)計(jì)方法一體的藥物發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。依托于智藥大腦平臺(tái)，英飛智藥擁有業(yè)界領(lǐng)先的候選藥開(kāi)發(fā)成功率，致力于高效批量開(kāi)發(fā)First-in-Class 創(chuàng)新藥物品種，同時(shí)也為醫(yī)藥企業(yè)的新藥研發(fā)提供先進(jìn)的技術(shù)服務(wù)和解決方案。